Para compilar o aRT no Windows, siga os seguintes passos:
baixar a TerraLib nova e substituir os arquivos do diretório do Emiliano
compilar a TerraLib a partir do Eclipse (abrir o projeto, e executar project→clean)
copiar os .a para o diretorio do aRT
alterar os makefiles de aRT/src (nova versão do R, etc.)
R CMD build aRT
strip em todas as dlls (menos a libmysql.dll)
colocar as dlls no zip gerado manualmente (o R coloca apenas o aRT.dll)
atualizar o MD5