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Dados e Mapas
São ilustrados aqui como obter, importar, manipular, combinar e visualizar em mapas temáticos dados públicos do IBGE e DadaSUS
Lembrar de mudar diretorio de trabalho se necessário
setwd("...")
Primeiro vamos obter um arquivo de mapa do IBGE:
O mapa foi carregado do site do IBGE em <Geociências> + <Mapeamento das unidades territoriais> + <Produtos> + <Malha municipal digital 2007> (clicar no disquete de 2007) Na nova janela: Escolha E500, E100 ou E2500 Escolha uma projeção .Usado: Proj_Geografica Escolha um formato. Usado: ArcView_shp Escolha um nível territorial. Escolha a unidade territorial.
Salve os arquivos com extensão .shp, .shx e .dbf
Carregando pacotes maptools e sp
require(maptools) require(sp)
Lendo o mapa no (Site do IBGE pode ser demorado. Os arquivos 12mu500gc* podem ser copiados daqui)
ac <- readShapePoly("12mu500gc") ### visualizando plot(ac) ### atributos dos municipios (variáveis) names(ac) ### atributos/elementos do objeto names(attributes(ac)) ### bounding box bbox(ac) ### inspecionando os atributos (dados) dos municípios dim(ac@data) ac@data[1:3,]
Obtencao dos dados do [[http://www.datasus.gov.br|datasus]] - clicar em <Informacoes de Saude> - clicar em <Demograficas e Socioeconomicas> - Clicar em Abastecimento de agua - 1991, 2000 - Selecione Brasil por Municipio - Montar a tabela assim: - Linha: Muncipio <Todas as categorias> - Coluna: Abastecimento de Agua - Conteudo: Moradores - Clicar em Formato: <Tabela com bordas> e <Mostra> (no final da pg.) - Após os dados serem mostrados, clicar em <Copia com o .CSV> e salvar o arquivo
Alternativamente aqui os dados de abastecimento de agua, do arquivo obtidos a partir do site do DATASUS
agua <- read.csv2("A104241200_17_213_55.csv", skip=3) system("file -bi A104241200_17_213_55.csv") ## encondings em diferentes sistemas! dim(agua) agua[1:3,] </code Combinando as bases. Notar que é necessário colocar dados na mesma ordem do mapa. <code R> ### extraindo o codigo de municipios dos dados codmund <- substr(as.character(agua[,1]), 1, 6) codmund[1:3] ### extraindo o código do mapa com apenas 6 digitos ac@data[1:3,] cod6map <- substr(as.character(ac@data[,1]), 1, 6) head(cod6map, 3) ### selecionando os dados do ACRE ### e preservando a ordem do mapa odat <- merge(data.frame(cod=cod6map), data.frame(cod=codmund, agua[,-1]), sort=FALSE) dim(odat) names(odat) table(odat$cod==cod6map) ### verifica ordem ### adiciona os dados ao SpatialPolygons ac@data <- data.frame(ac@data, odat[,-1]) ### proporcao de rede geral ac@data$prg <- (odat[,2]+odat[,3])/odat[,10] spplot(ac, "prg") spplot(ac, "prg", col.regions=heat.colors(16)) ### visualiza no mapa ### criando 3 categorias cat3 <- findInterval(ac$prg, c(0, .12, .25, 1)) table(cat3) ### três cores cores3 <- c("red", "orange", "yellow") ### plotando o mapa temático par(mar=c(0,0,0,0)) plot(ac, col=cores3[cat3]) legend("topright", leglabs(c(0,12,25,1), "<", ">"), fill=cores3, bty="n", cex=2)
Uma análise:
### carrega pacote spdep require(spdep) args(EBImoran.mc) nb <- poly2nb(ac) nb plot(nb, coordinates(ac), add=T) nbw <- nb2listw(nb) eb <- EBImoran.mc(odat[,10], odat[,2]+odat[,3], nbw, 999) eb
HELP !!!
help(EBImoran.mc) ## ou simplesmente ?EBImoran.mc ## tipos: "text", "html", "postscript", "ps", "pdf".