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Tabela de conteúdos
Histórico das aulas do curso
Ano 2010
Semana 1
- 16/09
- Manhã:
- Tarde:
-
- 17/09
- Manhã:
- arquivo de dados de teores de elementos em camada 0-20
- arquivo de comandos editado na aula da tarde
- Tarde
- Análise de Fosforo mostrada na aula
- arquivo com teores de elementos quimicos em amostras de solo
Semana 2
- 23/09
- Scripts de simulação de Processos Gaussianos e de Dados geoestatísticos
- Simulação de dados não Gaussianos (modelo linear generalizado geoestatístico
- 24/09
- script modificado do dia 24/09 (atualizado, atualizar também a instalação da geoR)
- Tarde : Exemplos de Importação de Dados(Ricardo Olinda)
- Tarefa 1 : montar geodata a partir da importação de dados de centroídes de municípios do Paraná
- Arquivos de dados:
Semana 3
- 14/10
- Simulações condicionais e predição de funcionais
require(geoR) ml <- likfit(s100, ini=c(1, 0.3)) gr <- expand.grid(seq(0,1,len=50), seq(0,1, l=50)) args(output.control) ## definindo simulacoes nos resultados (output) OC <- output.control(n.pred=1000, simulations.pred=T) kc <- krige.conv(s100, loc=gr, krige=krige.control(obj.m=ml), out=OC) ## vendo o que tem nos resultados names(kc) str(kc) ## os simulacoes ficam armazenadas aqui dim(kc$simulations) ## calculando (predizendo) FUNCIONAIS ## FUNCIONAL 1: mapa de probabilidade do atributo estar acima de 1,8 p1.8 <- apply(kc$simulations, 1, function(x) mean(x>1.8)) length(p1.8) image(kc, val=p1.8) ## adicionando legenda args(legend.krige) legend.krige(x.leg=c(1.05, 1.1), val=p1.8, y.leg=c(0.2, 0.8), vert=T) ## mudando os limites da image para incluir a legenda image(kc, val=p1.8, xlim=c(0, 1.2)) legend.krige(x.leg=c(1.05, 1.1), val=p1.8, y.leg=c(0.2, 0.8), vert=T) ## Outro funcional: proposção da área com valores acima de 1,8 A1.8 <- apply(kc$simulations, 2, function(x) mean(x>1.8)) length(A1.8) hist(A1.8, prob=T) lines(density(A1.8)) rug(A1.8) summary(A1.8) ## outro funcional : distribuição dos máximos sobre a área MAX <- apply(kc$simulations, 2, function(x) max(x)) length(MAX) hist(MAX, prob=T) lines(density(MAX)) rug(MAX) ## probabilidade do MAX está acima de 4 mean(MAX > 4) ## idem para minimo MIN <- apply(kc$simulations, 2, function(x) min(x)) summary(MIN) hist(MIN, prob=T) lines(density(MIN)) rug(MIN) ## ## um outro funcional diferente do anterior seria um mapa de maximos POR PIXEL MAX.map <- apply(kc$simulations, 1, function(x) max(x)) length(MAX.map) image(kc, val=MAX.map)
Ano 2009
Semana 1
- 17/09
- Manhã:
- Tarde:
- arquivo de dados de teores de elementos em camada 0-20
- arquivo com teores de elementos quimicos em amostras de solo
- arquivo de comandos editado na aula da tarde
- 18/08
- Manhã:
- Efetuar análises com variáveis dos dados dos arquivos acima. Escolher alguns arquivos e variáveis procurando fazer análises adequadas.
- Depois de ter tentado efetuar as análises mencionadas acima, experimente reproduzir os comandos dos arquivos a seguir. Reflita sobre os comandos utilizados e discuta os resultados.
- Arquivo de comandos (análise do fósforo (P) de
profund020a.txt - Arquivo com comandos do R com análise geoestatística utilizados na aula
Semana 2
- 24/09
- Manhã: Propriedades dos modelos geoestatísticos e funções de correlação
- Tarde: Propriedades dos modelos e simulação de campos aleatórios Gaussianos
- 25/09
- Manhã: Estimação de parâmetros: variogramas e verossimilhança
- Tarde: Predição espacial (krigagem)
Semana 3
- 22/10
- Manhã: prática e Explorando a predição espacial: simulação condicional e predição de funcionais genéricos.
- arquivo de comandos: análise de ctc40
- Dados:
- Tarde: prática e Análise espacial de experimentos
- 23/10
- Manhã: Inferência Bayesiana para modelos geoestatísticos
- Tarde: Integração com ambientes de SIG e p pacote aRT
Semana 4
- 29/10
- Manhã: Revisão de análise Bayesiana do modelo geoestatístico
- Tarde: Modelos Multivariados e Modelos para dados composicionais
- simulação de dados bivariados
- estimação e predição de dados bivariados
- arquivo com comandos para análise dos dados composicionais
- 30/10: Modelo Linear Generalizado Geoestatístico
- arquivo com código para exemplo de simulação e análise de dados binários em 1-D
- arquivo com código para exemplo de simulação e análise de dados de contagem (Poisson)
Ano 2008
Semana 1
- Aula 1 (01/09/2008):
- Manhã: introdução a estatística espacial. Análise espacial, estatística espacial e geoestatística
- Transparências do curso, Session 1 Apresentação da primeira semana
- página com comandos ilustrando algumas funcionalidades de estatística espacial
- tarde: tipos de problemas e estruturas de dados em geoestatística
- Transparências do curso, Session 2
- Aula 2 (02/09/2008): introdução à análise geoestatística de dados
- Arquivo de dados usado na aula (manhã)
- Arquivo de comandos (análise do fósforo (P) de
profund020a.txt - Arquivo com comandos do R com análise geoestatística utilizados na aula (2007)
Semana 2
- Aula 3 (08/09/2008)
- Uma visão de geoestatística baseada em modelos
tranparências do curso, Session 3
- Aula 4 (09/09/2008)
- Manhã: propriedades do modelo geostatístico e extensões. Simulação de dados
transparâncias do curso Session 4 & 5 - Tarde:
- extensões do modelo básico
transparâncias do curso Session 5 (cont.) - Estimação: variogramas e verossimilhança. Cross-validação. Escolha de modelos e critérios. Estudos de caso.
transparências do curso Session 6.
- Atividade: para próxima aula deve-se:
- entregar o artigo e a resenha sobre ele. pode ser impresso ou eletrônico
- é altamente desejável que já tenham o banco de dados com análises feitas. Não compulsória a entrega ainda mas será para próxima aula. Na próxima aula devem discutir qq dúvida referente aos dados comigo e colegas.
Semana 3
- Aula 5 (29/09/2008): predição espacial - krigagem. Propriedades, algorítmos e exemplos
- Transparências do curso, Session 7: Fundamentos da interpolação espacial (krigagem)
- arquivo de comandos utilizado na aula
- Aula 6 (30/09/2008)
- Dados: regioes.dat Estendendo a predição espacial
simulações condicionais e predição de funcionais genéricos. Predição Bayesiana e Análise espacial de experimentos - arquivo de comandos: análise de ctc40
Semana 4
- Aula 7 (20/10/2008): GLGM
- Transparências do curso, Session 9: GLGM
- arquivo de comandos para simulação de GLGM
- Aula 8 (20/10/2008): GLGM
- Transparências do curso, Session 10: GLGM - estudos de caso
- Simular dados nas coordenadas as estações meteorológicas do Paraná (geoR:
data(parana)) segundo o GLGM Poisson de média
,
,
e offset pelos dados no arquivo (mesma ordem das coordenadas das estações):- arquivo com valores de offset para simulação
- Analisar os o conjunto de dados simulados usando a geoRglm obtendo inferências sobre os parâmetros e predição da intensidade no estado
Semana 5
- Aula 9 (03/11/2008): GLGM e extensões do modelo geoestatístico
- Transparências do curso, Session 9: GLGM - comentários adicionais sobre implementação do algorítimo MCMC na geoRglm
- Estudos de caso, RAPLOA: Transparências do curso, Sessão 10
- Extensões do GLGM: variogramas e processo pontual Log-Cox Gaussiano, Transparências do curso, Sessão 11
- Processos pontuais marcados e amostragem preferencial, Transparências do curso, Sessão 11
- artigo de Schlather, Ribeiro e Diggle sobre teste de independência entre marcas e pontos
- artigo de Yongtao Guan sobre o mesmo tema
- Delineamentos geoestatísticos, Transparências do curso, Sessão 11
- Simular processos pontuais:
(a)Poisson homogêneo,(b)Poisson não homogêneo,©Log-Cox Gaussiano. No ultimo caso verificar o efeito dos parâmetros do modelo. - Simular processos pontuais marcados:
(a)com marcas e pontos independentes,(b)marcas e pontos dependentes - Aula 10 (04/11/2008): Extensões do modelo geoestatístico
- modelos espaço temporais - opções e abordagem utilizando funções de covariância espaço temporais. Um exemplo de aplicação
- combinando geoestatística e análise de dados composicionais – um exemplo na avaliação de estoque de peixes
- Modelos geoestatísticos multivariados. Construção de modelos, opções e o BGCCM
- Classes para dados espaciais no pacote sp
Outros conjuntos de dados e arquivos de comandos
- dados de características de solo (arquivo de dados)
- precipitação no PR em 1993 (arquivo de dados)
- propriedades físicas do solo (arquivo de dados)
- porosidade e outras características do solo a 30 cm (arquivo de dados)
- Arquivo com comandos do R com análise geoestatística utilizados durante aula
- outro arquivo com comandos do R com análise geoestatística utilizados durante aula